Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms