Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhobtb3Q9CTN4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms