Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp13a2Q9CTG6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms