Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9CR55 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CR55 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Q9CR55 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Q9CR55 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CR55 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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