Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ska2Q9CR46 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms