Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klhl28Q9CR40 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms