Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms