Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rer1Q9CQU3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rer1Q9CQU3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms