Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms