Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdm1Q9CQK3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms