Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufb9Q9CQJ8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms