Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RTRAFQ9CQE8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms