Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms