Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Rpl39lQ9CQD0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl39lQ9CQD0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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