Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lyrm1Q9CQB7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lyrm1Q9CQB7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms