Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
StambpQ9CQ26 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StambpQ9CQ26 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms