Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ska1Q9CPV1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms