Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssxb1Q9CPU1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms