Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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