Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl17Q9CPR4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms