Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms