Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scd3Q99PL7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms