Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc4Q99PH1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc4Q99PH1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms