Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcgf6Q99NA9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcgf6Q99NA9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms