Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf17Q99MV7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf17Q99MV7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms