Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp1b1Q99LU0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms