Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcf2Q99LE6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms