Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SardhQ99LB7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SardhQ99LB7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms