Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99KU6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99KU6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99KU6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99KU6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99KU6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q99KU6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q99KU6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q99KU6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms