Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms