Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clint1Q99KN9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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