Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms