Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lims1Q99JW4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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