Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krcc1Q99JT5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krcc1Q99JT5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms