Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Def8Q99J78 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms