Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu1Q99J10 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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