Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1dQ99246 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1dQ99246 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1dQ99246 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cacna1dQ99246 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1dQ99246 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms