Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms