Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim7Q923T7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms