Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd1Q923L3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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