Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clip1Q922J3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms