Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msi2Q920Q6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi2Q920Q6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms