Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Odf3Q920N1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Odf3Q920N1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms