Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx18Q91ZR2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms