Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpe65Q91ZQ5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms