Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Pde6cQ91ZQ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pde6cQ91ZQ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pde6cQ91ZQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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