Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lims2Q91XD2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lims2Q91XD2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms