Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms