Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd3Q91W18 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd3Q91W18 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms