Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp4Q8VHC5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp4Q8VHC5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms